POSKESTREN (Pos Kesehatan Pesantren) adalah kegiatan pelayanan medis dan penyediaan informasi tentang kesehatan bagi warga SPMAA dan masyarakat umum. POSKESTREN SPMAA membuka layanan selama 24 jam non-stop. Saat ini kegiatan POSKESTREN SPMAA didukung oleh tenaga medis dokter, perawat, bidan dan relawan yang bekerja membantu sukarela.

Selain memberikan layanan standar seperti medical fisrt aid, gawat darurat, rawat inap, layanan kesehatan ibu dan anak (BKIA), POSKESTREN SPMAA juga rutin menyelenggarakan kegiatan edukatif seperti penyuluhan secara massal, magang kerja bagi mahasiswa sekolah medis,  dan home visit kepada masyarakat.  Materi yang diberikan a.l kesehatan reproduksi, sosialisasi tanaman obat keluarga (toga),  kajian keputrian, penyuluhan gizi keluarga, kampanye anti-rokok, rumah sehat sederhana, praktik penyembuhan alternatif, dst.

POSKESTREN SPMAA juga dilibatkan aktif  ketika ada kegiatan respon bencana atau kejadian luar biasa melalui tim kesehatan SANTANA (Santri Tanggap Bencana). Untuk penguatan kapasitas kelembagaan dan peningkatan kualitas layanan, POSKESTREN SPMAA seringkali mengadakan kegiatan bersama dengan elemen/komunitas masyarakat kesehatan lainnya. Biasanya kegiatan dikemas dalam acara seminar, pelatihan, praktik pengobatan massal, dan donasi obat murah.

Meski menggiatkan pelayanan secara swadaya, POSKESTREN SPMAA tetap membuka peluang bagi para pihak peduli yang ingin urun partisipasi.  Bentuk partisipasi bisa beragam, mulai dari sekadar kunjungan, undangan pelatihan, kerjasama bhakti sosial, wakaf tenaga medis sukarela, hingga donasi peralatan/fasilitas medis yang saat ini masih belum memadai.